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肝细胞癌中m6A调节剂和m6A相关基因的整合分析

宣布为BIO Integration期刊发表新的文章。本文的作者为谢景盾,齐振华,罗小林,方艳,邢伟,曾伟安,陈东泰和李强;来自中国广东省广州市中山大学的研究人员讨论了肝细胞癌(HCC)中m6A调节剂和m6A相关基因的整合分析。

真核mRNA的N6-甲基腺苷(m6A)RNA甲基化与各种肿瘤的进展有关。这项研究通过整合的生物信息学分析,全面分析了m6A调节剂和m6A相关基因,包括表达,聚类,蛋白质-蛋白质相互作用和预后,从而为m6A调节剂和m6A相关基因在肝癌中的作用提供了新颖的见解。

获得了192个候选m6A相关基因和3个m6A调节子,包括YTHDF1,YTHDF2和YTHDC1。这些基因和调节子的表达在肝癌的不同阶段显着不同。基于Cox回归分析,获得98个与m6A相关的预后基因中的19个,以构建风险评分模型。HCC患者的1年和3年曲线下面积(AUC)大于0.7。通过对高风险和低风险评分组之间的突变差异进行分析,作者确定TP53在高风险HCC患者组中具有最高的突变频率,而替丁(TTN)在低风险中具有最高的突变频率。肝癌患者组。

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