罕见的上消化道的细胞类型

汉斯·克莱弗斯(Hans Clevers)组的研究人员鉴定并鉴定了上消化道中的稀有细胞类型。他们使用单细胞RNA测序研究了食道，胃和小肠上部的细胞组成。他们提供了这些器官中所有上皮细胞的详细基因表达分析。此外，他们鉴定出一种罕见的细胞类型，最有可能导致人类大量分泌水。这种细胞类型为囊性纤维化患者的胃肠道缺陷提供了联系。该论文于3月9日发表在《细胞报告》上，并作为该领域其他科学家的参考资料。

人体中的每个细胞都拥有该人的所有遗传信息-DNA。但是，细胞仅主动读取执行其功能所需的DNA部分;哪一部分取决于单元格的类型。相关的基因被转录成RNA，作为蛋白质生产的蓝图。借助一种称为单细胞RNA测序(scRNA-seq)的技术，研究人员可以研究单个细胞中RNA的存在和数量，从而深入了解这些细胞的基因表达谱。

上消化道

在Cell Reports的新出版物中，来自Clevers实验室的研究人员描述了他们如何使用scRNA-seq来研究上消化道上皮(细胞的薄薄保护层)沿上皮的不同细胞类型的基因表达谱。该道包括食道，胃和小肠的上部。为此，他们从健康的人体组织中获得了活检样本，并将获得的数据与小鼠数据集进行了比较。尽管论文的主要目的是表征和描述这些器官中不同的细胞类型，但研究人员还获得了一些有趣的发现。

激素产生细胞

他们发现了食管干细胞群中COL17A1基因的高表达。尽管已知该基因的突变会导致皮肤出现水疱病，但在这些患者中几乎没有与食道有关的缺陷报道。此外，研究人员对胃中的细胞组成进行了表征，发现负责组胺产生的细胞也表达了黄体生成激素(LH)。这种激素最有名的是它在女性生殖周期中的排卵中起作用，并在男性中调节睾丸激素水平。胃中这些细胞为何产生LH的原因尚不清楚，需要进一步研究。

稀有电池类型

在研究小肠的上部时，研究人员发现了一种罕见的细胞类型，具有4种基因的高表达，这些基因均与大量水的分泌有关。最突出的成员是CFTR基因。CFTR中的突变会导致囊性纤维化(CF)，这是一种主要表现在肺部的疾病。但是，CF患者也遇到与胃肠道梗阻有关的问题。这是由粘稠的，水合的粘液层引起的，这很可能与CFTR基因在小肠中的表达有关。