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蛋白质相互作用研究中新的和尚未探索的领域

需要许多蛋白质来维持DNA的结构并保持其遗传完整性。滑动夹是增加DNA复制效率的蛋白质。没有这些蛋白质,细胞将无法进行连续的DNA合成,从细菌到人类的生物也将无法生存。

滑动夹是环绕DNA并与DNA聚合酶结合的环形蛋白质,DNA聚合酶执行实际的DNA复制。它们有效地组织和定向了DNA及其辅助蛋白,以便能够复制。滑动夹是寡聚蛋白;它们由一种以上称为单体的单个蛋白质的相同副本组成。

称为β的细菌大肠杆菌钳由两个相同的单体组成。人体细胞包含称为PCNA的夹具,该夹具由三种相同的单体组成。这些相同单体之间的强大分子间力确保环在溶液中稳定,并且在复制过程中不会从DNA上脱落。

滑动夹具的单体自组装成稳定的甜甜圈形状的环受离子和其他分子间力控制。已知这些结构的组装会受到盐的存在的影响,但是对该自组装的其他形式的分子控制还没有被很好地理解。为了理解夹具自组装的分子基础,分子科学学院副教授Marcia Levitus和同事现在发现,这些蛋白质甜甜圈在暴露于细菌通常用来耐受的分子时会以未知的方式组装。环境中盐含量高。

具体而言,发现谷氨酸钾(KGlu)和甘氨酸甜菜碱可促进β和PCNA夹具自组装成包含许多面对面堆叠的甜甜圈的结构。这些结构类似于甜甜圈管,仅在细胞需要耐受生长培养基中高盐浓度的细胞存在的化合物存在下才能观察到。

他们的研究刚刚发表在《生物物理杂志》上,是与佛罗里达大学生物化学和分子生物学系的琳达·布鲁姆教授长期合作的结果。

Levitus解释说:“在这项研究中,我们研究了非库伦对滑动夹的自组装性能的影响。” “我们使用荧光相关光谱法确定了两个滑动夹的相对扩散系数。尽管到目前为止,我们已经使用两个滑动夹进行了研究,但我们的结果表明我们的发现并不特定于这些蛋白质,并且可以推广到广泛的蛋白质-蛋白质相互作用中。” Levitus还是单分子生物物理学生物设计中心的一部分。

细胞在压力下会积累谷氨酸和相关分子,因此在这些条件下形成高阶蛋白组装体具有重要的生物学意义。具体而言,这将代表一种机制,通过该机制,细胞中应激源化合物的存在可以控制DNA复制。

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