MicroRNA在驱动癌症中显示出意外的功能

费城-研究人员长期以来一直认为，双链microRNA的只有一条链可以使基因沉默。尽管最近的证据对这种教条提出了挑战，但尚不清楚另一条链的作用，以及两者可能如何参与癌症。托马斯·杰斐逊大学的一项新研究表明，某些microRNA的两条链协同作用于多种癌症之间的同一癌症途径，以促进侵袭性和生长-癌症患者预后不良的两个标志。

“这种活动的协调确实令人惊讶，”杰斐逊癌症生物学系教授兼副主席，悉尼·金梅尔癌症中心分子生物学与遗传学计划的共同负责人，克里斯汀·M·艾森博士说。SKCC)-杰斐逊健康。“我们知道这些链不会击中相同的靶序列。但是尽管如此，我们仍然看到它们正在协同工作。”

研究人员并未对microRNA的两面给予太多关注，部分原因是为探测microRNA而创建的试剂仅针对一条链，“因此，从一个领域来看，我们并没有看到全部图片，” Eischen博士说。

这项工作发表在2020年2月20日的《自然通讯》上。

第一作者Ramkrishna Mitra博士是Eischen博士实验室的研究讲师，他首先使用一种计算方法，使他能够搜索microRNA的两条链。Mitra博士说：“我们的数据表明，许多对中的一对并没有像以前所认为的那样降解。我们在许多癌症中都看到了大量的两对。”

研究人员从来自14种癌症的5200个癌症患者样本中获得的数据中，发现26种microRNA对在多种癌症中表现出更高的活性和丰富性或更低的活性和丰富性。

Eischen说：“然后，我们缩小了对最大效应的搜索范围。”Mitra博士开发了一种新的计算生物学方法，部分是通过分析290种癌细胞系中癌细胞存活和生长所必需的基因来确定两种microRNA对影响多种癌症类型的途径。研究人员还确定，与单独的两条链相比，哪些microRNA对对共同驱动或抑制癌症生长的影响更大。

他们找到了两对合适的对，分别是miR-30a和miR-145。Eischen博士说：“每对都有不同的靶基因，但靶标靶向相同的癌症途径。”“从患者数据和肿瘤细胞系中可以看出，这些微RNA有助于控制癌症。结果，许多癌症，例如肾癌，肺癌，乳腺癌等，在失去这些微RNA时变得更具攻击性，这会影响患者的生存。 ”

为了验证其计算工作的结果，研究人员使用实验方法复制了发现的结果。他们强迫miR-145和miR-30a在肺癌细胞系中表达，从而降低了癌症的侵袭性特征，特别是其生长和迁移。

Jefferson Health肿瘤服务执行副总裁Karen Knudsen博士说：“ SKCC具有与癌症中的小RNA功能相关的悠久发现历史，而Eischen博士的突破具有理解肿瘤发展和肿瘤进展的巨大潜力。以及Sidney Kimmel癌症中心的企业总监-Jefferson Health，这是美国仅有的NCI指定的71个癌症中心之一。