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科学家发现癌症的许多基因驱动因素

对患有38种不同类型癌症的2658人的整个基因组进行了大规模分析,确定了179个基因的突变和基因调节剂为“驱动因素”,即导致癌症发展的DNA序列变异。

这项工作是全基因组全癌基因分析(PCAWG)项目的一部分,该项目是迄今为止最全面的癌症基因组学研究之一,涉及17个国家的科学家和30多篇论文,其中包括耶鲁大学教授发表的几篇论文,这些论文早些时候已在多本期刊上发表过这个月。

尽管驾驶员在所分析的癌症病例中占很大比例,但他们并没有解释全部。包括耶鲁大学的马克·格斯坦(Mark Gerstein)在内的一些科学家现在认为,要更全面地了解癌症的进展,他们不仅需要更加关注经典的遗传驱动因素,而且还需要更加关注“乘客”-构成数千种非驱动因素的突变在典型的癌症基因组中观察到的绝大多数突变。从历史上看,科学共识认为它们在肿瘤生长中不起作用。

Albert L. Williams生物医学信息学教授Gerstein说:“许多突变对癌症的发展可能只产生很小的个体作用,但有明显的累积作用。”分子生物物理学与生物化学,计算机科学以及统计与数据科学教授;并于2月20日在Cell上发表论文的高级作者,该论文概述了乘客在癌症发展中的作用。

了解癌细胞如何从健康细胞形成,复制并迁移到不同器官的遗传根源,以及这一过程在肿瘤类型之间和个体之间如何变化,对于制定新的抗癌战略至关重要,而抗癌是全球范围内导致死亡的主要原因之一。

格斯坦(Gerstein),舒斯坦·库马尔(Sushant Kumar)是格斯坦(Gerstein)实验室的副研究员,他和同事们决定考虑“乘客”在癌症发展中的作用。在《细胞》杂志上的论文中,他们报告了旨在表明乘客突变是否可以帮助解释10%癌症病例(其中研究人员几乎没有或没有明确的遗传驱动力)的实验的实验。他们发现,一部分乘客会对基因组区域产生重大影响,通常与驾驶员的影响一样大,并且总体上可以对肿瘤的生长产生显着影响。

耶鲁大学的团队还对八种不同的癌症类型进行了集中的统计分析,检测出乘客对这些癌症发展的累积影响超出了仅驾驶员可以解释的范围。总体而言,他们的分析表明,在预测给定样品是否确实为癌症时,乘客还有9%的贡献。

格斯坦(Gerstein)强调,这些乘客变体中的某些实际上可以帮助阻止癌症的发展,而不是触发肿瘤的生长。这组作者说,了解乘客的全部作用可以帮助科学家开发出精确针对特定人癌症基因组中各个突变的疗法。

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