研究人员确定了用于肺癌诊断和预后的新生物标志物

应用生物信息学解决生物学问题。这是马拉加大学“ BI4NEXT”研究小组的目标，该研究小组是在超级计算和生物创新中心(SCBI)的基础上，基于生物库样品开发的最新研究之一，已经确定了用于诊断，预后的新生物标记。甚至治疗肺癌。

在科学杂志PeerJ上发表的一项发现，因为它证明了主要由转座子化石形成的重复DNA区域中的肿瘤细胞和健康细胞均以受控方式持续，差异表达。

UMA分子系教授Gonzalo Claros解释说：“自2010年以来，我们一直坚信健康细胞中的重复元件处于休眠状态，并且当细胞发生癌变时，这些区域会失控，表达异常并引起对治疗的抵抗力。”生物学和生物化学，他断言他的研究支持事实并非如此，正常和肿瘤组织中的重复序列都被特异性表达和调控。他说：“我们的证据是，当正常细胞发生癌变时，这种控制就会改变。”

因此，UMA的这个研究小组确定了在所有患者和所有类型的肺癌中表现相似的一些重复区域。这是在所有肺癌细胞中均被抑制的AluYg6和LTR18B元素，以及在腺癌和小细胞肺癌中分别特异性激活的HERVK11D-Int和UCON88元素。

一项尚待实验室验证的生物信息学研究仍在向肺癌的确诊诊断迈出一步，同时它也为专家提供了新的信息来源，可扩展到具有遗传成分的所有疾病。

生物标志物的新来源

“ BI4NEXT”研究人员建议研究重复性元素(占基因组的50%以上)，作为一种新的生物标记物来源，至今仍未得到充分利用。因此，它们强调了基于高通量测序的基因组突变以及这些表达标记的分析所带来的准确性，成本和时间节省。

将其转化为临床应用是这一组科学家面临的挑战，作为一种潜在的解决方案，他们提出了使用液体活检来寻找转座子的重复序列的方法，这些序列如前所述一直表达。Claros指出：“诊断的鲁棒性将提高，而且所需的时间和样本量将更少。”

在这项研究中，研究人员将来自同一患者的健康组织和肿瘤组织进行了近3年的比较，该分析通常在不同患者的组织上进行。根据公共数据库，对来自韩国的50名患者和来自中国的17名患者的生物库样本进行了分析，最终有8位来自马拉加地区医院的患者通过生物库参加了研究。

分子生物学教授说：“仅通过对马拉加生物库中的八名患者进行测序，并为此目的使用SCBI和毕加索超级计算机的高通量测序平台，我们就可以从其他数据库中获得对其他数千名患者进行验证的数据。”生物化学，他还指出，所有这些信息都可供科学界使用。

马拉加地区医院肺病学家Macarena Arroyo是这项研究的主要作者，她于2013年以博士学位论文的身份在Gonzalo Claros教授的领导下与肿瘤学家Manuel Cabo和RocíoBautista生物学博士一起开始研究和UMA的生物信息学专家。如今，这项研究代表了新研究领域的起点，例如最近在PeerJ发表的科学文章。